Untuk memastikan suasana belajar mengajar berlangsung optimal dan nyaman, MTs Muallimin UNIVA Medan menyediakan ragam fasilitas unggulan, antara lain: 1. Ruang Kelas Nyaman berpendingin udara dan dilengkapi perangkat multimedia presentasi interaktif. 2. Laboratorium Komputer & Jaringan Internet Cepat untuk mendukung asesmen digital, pelatihan coding santri, dan literasi teknologi informasi. 3. Perpustakaan Terpadu yang mengoleksi ribuan judul buku teks, kitab klasik pesantren, serta referensi ensiklopedia Islam dan sains modern. 4. Masjid Jami' UNIVA Medan sebagai episentrum ibadah harian santri, sholat dhuha, sholat berjamaah, dan majelis tilawah Al-Qur'an. 5. Lapangan Olahraga multifungsi untuk futsal, basket, bulutangkis, dan kegiatan kepanduan Pramuka.